Landskabet
Saltholm er omgivet af ca. 2800 ha fladvand (under 2m dybde), der strækker sig 1,5 km ud fra kysten. Ved øens sydende findes en række småøer og holme - bl.a. svaneklapperne og koklapperne, samt stenstrøninger fra sidste istid. Saltholm hævede sig op over havet for ca. 4000 år siden, og der foregår stadig landhævninger, som især ændrer landskabet i den sydligste del.

Plante- og dyreliv
Det lavvandede farvand omkring Saltholm er et meget vigtigt fødesøgningsområde for vandfugle. Snegle, muslinger, orme, krebsdyr o.a. forekommer sammen med fisk og fiskeyngel i store mængder. Herudover er der store frodige undervandsbevoksninger af hav- og ålegræs. Foruden at være en vigtig yngleplads er Saltholm og det omkringliggende fladvand et betydningsfuldt rasteområde for vandfugle i tusindtal. (Se oversigt).

Fuglebeskyttelsesområde
Saltholm med omgivende vader, fladvand og øer er af international betydning for en række arter af vandfugle. Området er derfor også udpeget som særligt fuglebeskyttelsesområde i henhold til et EF-direktiv. Dette forpligtiger os til at passe særligt godt på naturområdet og beskytte stedets fugleliv. Derfor er såvel Saltholm som det omkringliggende farvandsområde nu fredet.

Fredningsbestemmelser for færdsel, sejlads og jagt

Indenfor hele det fredede område:
· Forbud mod sejlads med hoovercrafts,
vandskootere, jetski o.l. samt brætsejlads.

· Sejlads med motor må ikke ske med større
hastighed end 10 knob.

Færdselsforbud:
· Sejlads og færdsel er forbudt indenfor
en afstand af 25 m. fra Saltholm. Landgang
må kun ske ved Barakkebro.

· Sejlads og færdsel er forbudt omkring den
sydlige del af Saltholm og ved Søndre Flint.

Jagt:
· Jagt er forbudt SV, S og Ø for Saltholm, og i disse områder må skydevåben tillige ikke medbringes i skydepram.

· På det øvrige vandområde må jagt først gå i gang den 16. september. Endvidere er jagt efter kl. 12 ikke tilladt.

Der gælder undtagelse fra færdselsbegrænsningerne for erhvervsfiskere samt for personer med en særlig tilknytning til Saltholm. Færdsel kan derfor forekomme i områder, hvor andre ikke må færdes.
Øen Saltholm er fredet af Overfredningsnævnet i 1983. Der er også særlige regler for færdsel på land. Disse er vist på kortet.

SÆRLIGE FUGLEFORKOMSTER OMKRING SALTHOLM
I løbet af året er der nogle særlige fugleforekomster, som i dansk og international sammenhæng gør området omkring Saltholm til noget specielt. Disse er vist nedenfor. Herudover er der året igennem mange andre yngle- og rastende fugle. Endvidere yngler spættet sæl ved sydkysten, og man ser jævnligt gråsæl.
Knopsvane:
1) Om sommeren er området fældeplads for op til 3.500 unge svaner, som endnu ikke er kønsmodne.
2) Om vinteren opholder ca. 2.000 svaner sig på lavvandsområderne.

Svømmeænder: Efterår og sidst på vinteren/forår anvender tusindvis (max. 10-12.000 om foråret) af svømmeænder - gråand, krikand, pibeand mv. - lavvandsområderne som raste og fourageringsområde.

Grågæs: I maj/juni samles op til 7.000 fældende grågæs. Området er Danmarks største fældningsområde for gæssene, og anvendes formodentlig tillige af fugle fra dele af Østeuropa.

Ederfugl: Saltholm er Europas største ynglekoloni for ederfugl. Der ses op til 15.000 fugle om foråret. Efter parring ruger op til 7-8.000 hunner på øen. Hannerne forlader området i april-maj, og trækker til fældepladser i Kattegat/Vadehavsområdet. Når æggene klækkes søger hunnerne med deres unger straks ind til Sjællands kyst.